Юньнаньский университет традиционной китайской медицины является вузом, созданным совместно правительством провинции Юньнань и Государственным управлением традиционной китайской медицины. Это первый вуз, начавший подготовку специалистов в области народной медицины, первый вуз, открывший зарубежное обучение в области высшего образования по традиционной китайской медицине, а также единственный вуз в провинции Юньнань, предлагающий бакалавриат по традиционной китайской медицине. Предшественником Юньнаньского университета традиционной китайской медицины был Юньнаньский институт традиционной китайской медицины, основанный в 1960 году. В мае 1960 года на базе Юньнаньской школы традиционной китайской медицины был основан Юньнаньский институт традиционной китайской медицины, который стал вторым в стране высшим учебным заведением по традиционной китайской медицине. У Пэйхэн был назначен первым ректором. 1 сентября 1960 года Юньнаньская провинциальная больница традиционной китайской медицины была передана в качестве клинической базы для учебного заведения. В 1981 году стал одним из первых, кто получил степень бакалавра.